الشياطين التي دمرت العالم تقريبًا ، يتم إحياؤها من قبل شخص ما. لمنع العالم من التدمير ، يجب ختم الشيطان والشخص الوحيد الذي يمكنه فعل ذلك هو ضريح شيون الأول من بلد الشياطين ، الذي يمتلك قوتين ؛ أحدهما يختم الشياطين والآخر يتنبأ بموت البشر. هذه المرة مهمة ناروتو هي حراسة شيون ، لكنها تتوقع موت ناروتو. الطريقة الوحيدة للهروب منها ، هي الابتعاد عن شيون ، الأمر الذي سيتركها بلا حراسة ، ثم الشيطان الذي هدفه الوحيد هو قتل شيون سيفعل ذلك ، مما يعني نهاية العالم. يقرر ناروتو تحدي هذا "التنبؤ بالموت".

يبدأ النينجا مع حدود سلالة الدم بالاختفاء في جميع البلدان وإلقاء اللوم على أمة النار. بأمر من تسونادي ، كاكاشي ضحى لمنع حرب شاملة. بعد وراثة السحر الذي تركه كاكاشي ، يقاتل Naruto بين الأصدقاء والأعداء لمنع موته مع تغيير أذهان أولئك الذين ورثوا إرادة النار.

ينفذ Naruto و Shikamaru و Sakura مهمتهم المتمثلة في توصيل حيوان أليف مفقود إلى قرية معينة. ومع ذلك ، في خضم الأشياء ، هاجمتهم القوات بقيادة الفارس الغامض تيموجين. في المعركة العنيفة ، ينفصل الثلاثة. تيموجين يتحدى ناروتو في معركة وفي نهاية المعركة الشرسة ، كلاهما يسقطان معًا من جرف مرتفع ...

يشعر ناروتو بالإثارة عندما يتم إرساله في مهمة لحماية ممثلته المفضلة ، يوكي فوجيكازي ، في موقع تصوير فيلمها الجديد ، مغامرات الأميرة غيل. ولكن عندما يخرج الطاقم للتصوير في أرض الثلج الجليدية المنذرة بالخطر ، يوكي يهرب في ظروف غامضة! انطلق ناروتو وفريقه للعثور عليها ... غير مدركين أن نينجا الثلج الثلاثة ينتظرون ، بهدف شرير سيجبر يوكي على مواجهة ماضيها المخفي!

تقوم مجموعة غامضة من النينجا بهجوم مفاجئ على كونوها ، مما يتسبب في أضرار جسيمة. قد يصبح كابوس حرب شينوبي العالمية الأخرى حقيقة واقعة. ساسكي ، الذي كان لا يزال نينًا مفقودًا من كونوها يحاول قتل شقيقه ، إيتاشي ، يظهر للمرة الثانية أمام ناروتو في مكان غير معروف لمنع حدوث ذلك.

تم تكليف ناروتو أوزوماكي ، وكاكاشي هاتاكي ، وساكورا هارونو ، وروك لي بحماية أمير أرض القمر ، ميتشيرو ، خلال رحلته العالمية ؛ تم التعاقد مع مرافقين آخرين ، لكنهم استقالوا بسبب سوء معاملتهم. أرض القمر هي دولة غنية جدًا ، لذلك يميل ميتشيرو إلى شراء كل ما يريد ، ولديه نظرة مادية جدًا للعالم. كما يتصرف هيكارو بنفس الطريقة.

تم تعيين Naruto Uzumaki في مهمة للقبض على Mukade ، وهو نين مفقود ، ويبحث عن الآثار التاريخية المجيدة لـ "Ouran" ، حيث يلاحق النينجا الشفتين ويحركها. تم الكشف عن هدف موكادي على أنه خط نائم داخل الأنقاض ؛ يطلق العنان لقوة leyline ، مسبباً ضوءاً يغلف ناروتو ، ويرسله إلى الماضي ، قبل 20 سنة من بدء المسلسل. عندما يستيقظ ناروتو ، يتعامل مع الهوكاجي الرابع ، ميناتو ناميكازي.

منذ ستة عشر عامًا ، أطلق نينجا ملثم غامض العنان لمخلوق قوي يُعرف باسم الثعلب الشيطاني ذو الذيل التسعة في قرية كونوها المخفية ، مما أسفر عن مقتل العديد من الأشخاص. رداً على ذلك ، تمكن الهوكاجي الرابع ناميكازي وزوجته كوشينا أوزوماكي ، سجن الثعلب الشيطاني أو جينشوريكي ، من ختم المخلوق داخل ابنهما المولود حديثًا ناروتو أوزوماكي. مع ختم الوحش الذيل ، استمرت الأمور كالمعتاد. ومع ذلك ، في الوقت الحاضر ، انتهى السلام عندما أطلقت مجموعة من النينجا على هجوم أكاتسوكي كونوها بتوجيه من توبي ، الرجل المقنع الغامض وراء هياج فوكس منذ سنوات والذي ينوي تنفيذ خطته لحكم العالم من خلال تكفينه في الأوهام.

بعد عامين من أحداث حرب النينجا الرابعة الكبرى ، بدأ القمر الذي أنشأه هاجورومو أوتسوتسوكي منذ فترة طويلة لإغلاق تمثال جيدو بالنزول نحو العالم ، مهددًا بأن يصبح نيزكًا من شأنه أن يدمر كل شيء عند الاصطدام. وسط هذه الأزمة ، يحاول سليل مباشر من Kaguya Otsutsuki يدعى Toneri Otsutsuki خطف Hinata Hyuga ولكن ينتهي به الأمر باختطاف أختها الصغرى Hanabi. يقوم ناروتو وحلفاؤه الآن بمهمة إنقاذ قبل أن يجدوا أنفسهم متورطين في معركة أخيرة لتقرير مصير كل شيء.

بوروتو اوزوماكي ، ابن الهوكاجي السابع ناروتو ، هو نينجا ماهر يمتلك نفس الجرأة والعاطفة التي كان والده يمتلكها. ومع ذلك ، فإن الغياب المستمر لوالده ، المشغول بواجبات الهوكاجي ، يثبط حريق بوروتو. ينتهي به الأمر بمقابلة صديق والده ساسكي ، ويطلب أن يصبح ... متدربًا له !؟ يرتفع الستار على قصة الجيل الجديد!

بعد إلقاء القبض عليه بتهمة محاولة اغتيال رايكاجي ، زعيم كوموغاكوري ، وكذلك قتل جنين من كيريغاكوري وإواغاكوري ، سُجن ناروتو في هوزوكيجو: مرفق احتواء إجرامي يُعرف باسم سجن الدم. يستخدم موي ، سيد القلعة ، أسلوب السجن النهائي لسرقة السلطة من السجناء ، وذلك عندما يلاحظ ناروتو أن حياته قد استُهدفت. وهكذا تبدأ المعركة لكشف الحقيقة وراء جرائم القتل الغامضة وإثبات براءة ناروتو.