يروي مسلسل "البحر الذي في قلبي " حكاية امراة في الاربعين من العمر و اسمها "دينيز " تعيش حياة راقية مع زوجها و ابيها و صغارها ، و لكن يتدمر زواجها الذي استمر لعشرين سنة بسبب خيانة زوجها "علي خان " لها و هروبه مع عشيقته تاركا خلفه زوجته التي يحبها و ابنته المراهقة و ابنه الصغير و لكن ما تجهله "دينيز " ان ما عاشته من متاعب بسبب صديقة طفولتها "هوليا " و ذلك بسبب غيرتها منها و تتقاطع طرق "دينيز" صدفة مع "ميرات" وهو رجل شهم قام بحمايتها و قدم لها منزله و اصبحوا يعيشون مع بعض و لكن ما يضنه الكثيرون انه.

تكتشف " نيسان " ، وهي امرأة تعيسة ، ومريضة ، تائهة عالقة في صخب الحياة في المدينة ، طائفة مشبوهة في بحثها عن صديقتها التي اختفت بعد جلسة شفاء حضروها معًا. على الرغم من كل شكوكها ، لا تستطيع نيسان أن تغض الطرف عن وعود الطائفة ، وتتبع الرجل الغامض ، توفان ، في مغامرة مليئة بالمجهول.