بعد إلقاء القبض عليه بتهمة محاولة اغتيال رايكاجي ، زعيم كوموغاكوري ، وكذلك قتل جنين من كيريغاكوري وإواغاكوري ، سُجن ناروتو في هوزوكيجو: مرفق احتواء إجرامي يُعرف باسم سجن الدم. يستخدم موي ، سيد القلعة ، أسلوب السجن النهائي لسرقة السلطة من السجناء ، وذلك عندما يلاحظ ناروتو أن حياته قد استُهدفت. وهكذا تبدأ المعركة لكشف الحقيقة وراء جرائم القتل الغامضة وإثبات براءة ناروتو.

بوروتو اوزوماكي ، ابن الهوكاجي السابع ناروتو ، هو نينجا ماهر يمتلك نفس الجرأة والعاطفة التي كان والده يمتلكها. ومع ذلك ، فإن الغياب المستمر لوالده ، المشغول بواجبات الهوكاجي ، يثبط حريق بوروتو. ينتهي به الأمر بمقابلة صديق والده ساسكي ، ويطلب أن يصبح ... متدربًا له !؟ يرتفع الستار على قصة الجيل الجديد!